(整期定稿)网络首发时间:2019-07-25 09:51:21

为了解金花茶种质的遗传关系,利用SLAF-seq测序技术对在不同地区收集的25份金花茶种质与山茶科其他5份种质进行测序。以猕猴桃基因组为参照,对金花茶基因组DNA酶切构建SLAF-seq文库,利用SLAFseq测序技术对其进行高通量测序、SNP标记开发及其进化关系分析,在多态性SLAF标签上开发特异性SNP位点,最后根据SNP位点构建25份金花茶种质与山茶科其他5份种质的进化树。最终共开发1 471 113个SLAF标签,其中多态性SLAF标签有69 597个;共得到443 819个群体SNP位点,其中高一致性的群体SNP位点119 452个。遗传分析结果表明,金花茶种群的遗传多样性水平较高,可分成2个大的类群,其中第2类群包含了全部收集的金花茶种质,其又可分为3个亚族,这3个亚族的分化有明显的地域特征。第1亚族主要是来源于越南的金花茶品系,第2亚族由2个越南的金花茶品系和5个中国的金花茶品系组成,第3亚族全部由来源于中国的金花茶品系组成。研究结果从基因组水平揭示不同地区金花茶种质之间的遗传关系,所开发的SNP位点可进一步用于金花茶种群的进化分析、重要性状的关联分析等。

国家林业局948项目(2014-4-14); 广西壮族自治区林业技术推广示范项目(桂林科发[2016]2号);

金花茶; SLAF-seq; SNP; 遗传分析;

10.14067/j.cnki.1003-8981.2019.03.012

S685.14

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经济林研究

Non-wood Forest Research

2019年03期

ISSN:1003-8981

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