动物基因组选配方法与应用

何俊¹Fernando B.Lopes²吴晓林^1,2,3

1. 湖南农业大学动物科技学院 2. 美国威斯康星大学动物科学系 3. 美国纽勤公司生物信息与生物统计部

摘要：基因组选择（genomic selection, GS）是利用覆盖基因组的分子标记预测动物个体的估计育种值,可以提高选择的准确度和选择强度,缩短世代间隔,做到早选、准选,使动物育种发生了巨大变革。过去的10多年间,基因组选择技术应用于奶牛等动物的育种中,使种用动物的选择更为准确,遗传进展得到大幅提高。但基因组选择通常重视目标性状的遗传进展,而忽略了配种亲本个体间的遗传关系,因此也没有考虑到后代群体中近交程度的增加、遗传多样性的降低以及有害基因的纯合等问题,因此难以维持长期的遗传进展。2016年,一种具有可持续性的遗传选择方法被正式提出,称为基因组选配（genomicmating,GM）。该方法利用待选种用个体的基因组信息实施优化的选种和选配,可以控制群体近交的增长速率,实现长期且可持续的遗传进展。因此基因组选配方法比基因组选择的方法更适合于现代动物育种,尤其适用于地方品种的保护和遗传改良。本文综述了基因组选配的基本概念、方法和应用,并通过模拟的方法比较了6种选配方案的选择效果,旨在为动物育种方法的应用提供参考。

关键词：

基因组选择; 基因组选配; 优化贡献选择;

基金资助：

湖南省科技计划重点项目（编号:2018NK2081）；长沙市科技计划重点项目（编号:kq1801014）；湖南省百人计划项目和湖南省畜禽安全协同创新中心项目资助~~；