互花米草NAC转录因子家族的鉴定与表达分析

王涛涛^1,2杨勇^1,2魏唯²林辰涛²马留银²

1. 福建农林大学林学院 2. 福建农林大学基础林学与蛋白质组学研究中心

摘要：互花米草（Spartina alterniflora）作为一种海岸带盐生植物,高度耐盐胁迫,但因为缺少参考基因组,其耐盐的分子机制却尚未见报道。NAC家族蛋白是植物特有的转录因子,调控植物的生长发育和胁迫应答。为了鉴定互花米草NAC蛋白（Sa NAC）并探究它们与互花米草生长发育及胁迫响应之间的关系,本研究以互花米草三代全长转录组数据为参考,通过与水稻（Oryza sativa）、拟南芥（Arabidopsis thaliana）和玉米（Zea mays）NAC蛋白序列进行比对,并结合保守功能域进一步筛选,最终找到62个Sa NAC蛋白。从蛋白序列比对、进化、motif预测、同源性比较、亚细胞定位、组织表达以及非生物胁迫下的基因差异表达等方面分别对互花米草NAC家族成员进行分析,结果发现Sa NAC蛋白均含有保守的NAM结构域,且在进化上与水稻NAC家族具有一定的相似性;Sa NAC家族中的两个蛋白Sa NAC9和Sa NAC49在细胞核表达;另外,本研究还发现互花米草Sa NAC基因表达具有高度组织和胁迫应答差异性。这些结果表明互花米草NAC转录因子家族不仅具有保守的功能域,而且在调控互花米草的生长发育和非生物胁迫响应过程中具有重要的作用。

关键词：

互花米草; NAC; 转录因子; 基因家族; 基因表达;

基金资助：

福建农林大学林学高峰学科建设项目（编号：71201800725,71201800773）;福建农林大学优秀博士学位论文基金项目（编号：324-1122yb043）资助~~；